二代试管技术(PGT-II)是一种辅助生殖技术，主要用于解决某些遗传性疾病和染色体异常的问题。在这个过程中，医生会从您的卵子中提取一个细胞进行基因检测，然后将健康的胚胎移植到您的子宫中。这种方法可以提高生育成功率，降低遗传疾病的风险。

卵巢囊肿是指卵巢内形成的液体充满的囊状结构。它们可能是良性的，也可能是恶性的。大多数卵巢囊肿是良性的，通常不会引起严重的健康问题。然而，有些囊肿可能会影响生育能力，特别是那些较大或位于卵巢中心的囊肿。

关于您的问题，是否应该在发现卵巢囊肿后停止二代试管治疗，这取决于多个因素：

1. 囊肿的大小和类型：如果囊肿较小且为功能性囊肿(如黄体囊肿、卵泡囊肿等),通常不会影响生育能力。但如果囊肿较大或为非功能性囊肿(如囊腺瘤、畸胎瘤等),可能需要进一步检查和治疗。

2. 囊肿对生育的影响：如果囊肿确实影响了您的生育能力，那么在开始二代试管治疗之前，您可能需要先接受治疗以消除囊肿。一旦囊肿被消除，您可以继续进行二代试管治疗。

3. 二代试管治疗的进展：如果您已经完成了卵子采集和胚胎移植过程，但尚未进行胚胎植入前的基因检测(PGT),那么在发现卵巢囊肿后，您可能需要暂时停止治疗，以便对囊肿进行进一步检查和治疗。一旦囊肿得到妥善处理，您可以在医生的建议下恢复二代试管治疗。

总之，关于是否应该在发现卵巢囊肿后停止二代试管治疗，您需要与负责您治疗的医生进行详细咨询。医生会根据您的具体情况，为您提供个性化的建议和治疗方案。希望这些信息对您有所帮助，祝您早日实现生育愿望！